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大型褐藻是世界上最重要的海洋蔬菜和褐藻胶工业用海藻。其中海带是褐藻中较为高等并具有初步组织分化的大型藻类。为深入解析褐藻的进化历程和适应机制,挖掘与利用褐藻重要功能基因,加快分子育种和生物多样性保护的进程,黄海所发起并主持实施了大型褐藻基因组计划。
该研究团队获得了海带主要栽培品系的高质量基因组组装结果,覆盖了全基因组序列的98.5%,共有18733个蛋白编码基因。比较基因组学分析发现,海带基因组扩增主要源于基因家族的扩增。
研究人员还获得了有代表性的7份养殖海带和9份野生海带的高覆盖度基因组草图,通过比较分析,在全基因组水平上全面解析了栽培和野生海带种间遗传变异。研究人员表示,尽管养殖海带和野生海带存在不同程度的基因交流,但中国养殖海带主要来源于日本同一个地理群体,养殖品系已经呈现明显退化状态。
该论文阐释了首例大型褐藻泛基因组研究成果,为研究海带的遗传多样性及进化历程提供了范例;同时,为海带种质资源的保护、开发、利用,拓宽海带育成品种遗传基础,推进海带新品种培育进程提供了信息资源。
(原载于《中国科学报》 2015-05-06 第1版 要闻)
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